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[沙龙话题] 如何做好一个三维的细胞模型

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楼主
发表于 2013-9-23 20:58:26 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
@东湖珞珈

首先夸奖一下小东湖的设计基本上是很靠谱的。要表扬,不要打击。

下面说一下我的建议:

1,其实我跟小东湖一样,选择植物细胞,而不是动物细胞做。
     a, 因为植物细胞有细胞壁,可以将外壁的形状做的很规整。
     b, 植物细胞里面的各种细胞器都有,可以做成五颜六色的。比动物细胞更加美观;
     c, 植物细胞有个大液泡,占据了非常大的地方,其它的小东西就不大容易乱跑。
     d, 植物细胞的蛋白分泌并不是非常的活跃,所以就不需要担心大规模的内脂网(ER)和高尔基体(Golgi)的问题。
2,细胞要透明的,那么不如用有机玻璃来。做成一个上下两个都是平面,周围是六边形的形状。用透明的热塑料将接口给封起来。先做下面的,形成一个鱼缸的样子,然后往里灌东西,还可以不断的调整,最后将上面的面给封上就行了。
3,内部的液体最好也是要透明的,如果一定要搞个人工琥珀,我知道有做电子显微镜包埋用的树脂,有两种,一种是高温固定的,就是放烘箱里面烤,一种是放冰箱里面冻。但价格上是个很大的负担。我不推荐。
美国人用到的法子,你可以去这里去找一找,http://www.stevespanglerscience.com/。或者 http://www.fxsupply.com/materials/slime.html

我个人推荐两种法子,一个是买点agar,在美国,这个东西可以不算作食物,作为gelatin的替代物。就像爱菊轩推荐的。1%-1。2%就足够了。另外一个,直接拿面粉拌匀了熬浆糊,里面可以加防腐剂。这个里面容易有气泡,可以拿个大口袋包严了,用吸尘器吸一吸。气泡就出来了。但我建议你一定要预先做几次试一试。

4,细胞器用橡皮泥做固然是个想法,但要力压群雄,这根本不可能。我推荐一个法子,用橡皮泥做成里面的骨架,然后把这些小东西做成人工琥珀。这样就是透明的了。要注意,只有叶绿体是本身带颜色的,里面的基粒是绿色的,外面的是透明的。其它的细胞器,建议也用橡皮泥作为骨架,外层的琥珀部分加点食用色。以示区分。你让小孩赶紧做这个吧。

5,液泡可以用透明的气球代替,这样形状不定,但难点是如何将口扎好以后,将外面残留的部分给去掉还不留痕迹。

6,细胞核也可以用细胞器类似的法子来作。

不可以用食物,最好是环保的可以降解的材料;一定要是3D的。否则,最高分就是B了。

这个主要就是对着细胞器和内部的液体去的。如果有时间,我会建议用木头来作细胞器,那个更加逼真一些。橡皮泥主要成分也是面粉,所以不用担心老师在这方面唧唧歪歪。
沙发
发表于 2013-9-23 21:19:33 | 只看该作者
先回答了你再仔细看:
这个不是你能挑选的,必须同时完成动物和植物的细胞模型!

点评

唉,要不怎么说坑爹了!一个都不好做,还必须做两个!!  发表于 2013-9-23 21:28
汗,你没说清楚。  发表于 2013-9-23 21:25
板凳
发表于 2013-9-23 21:23:28 | 只看该作者
本帖最后由 东湖珞珈 于 2013-9-23 21:28 编辑

橡皮泥做小零件那个,是解决了“透明悬浮”问题之后另外一个必须解决的问题。可能比第一个问题更难解决。第一个问题找到合适的材料之后只是一个简单灌注的问题。而这些小零件每一个都不一样,每一个都必须认真的做,否则细节弄不出来。
昨天我试着用彩色粘土做线粒体,里面的那根螺线怎么也弄不出来,太细小了。
地板
 楼主| 发表于 2013-9-23 21:29:34 | 只看该作者
东湖珞珈 发表于 2013-9-23 21:19
先回答了你再仔细看:
这个不是你能挑选的,必须同时完成动物和植物的细胞模型!
...

动物模型反而更好办了,你把小东西给做出来,然后拿一个气球,把东西塞进去,然后保证细胞核在中间,往里灌胶体或者浆糊,就好了。出来应该是一个煎的荷包蛋的样子。

http://www.nature.com/nrg/journal/v6/n3/fig_tab/nrg1557_F3.html

最后拿胶给粘到木板或者纸板上,做出前进的前沿和后面的拖尾。
5#
 楼主| 发表于 2013-9-23 21:32:19 | 只看该作者
东湖珞珈 发表于 2013-9-23 21:23
橡皮泥做小零件那个,是解决了“透明悬浮”问题之后另外一个必须解决的问题。可能比第一个问题更难解决。第 ...

晕,不能这么做阿。

线粒体里面不是线阿,是一层层的连在一起的。

http://microbewiki.kenyon.edu/im ... px-Mitochondria.gif

http://micro.magnet.fsu.edu/cell ... chondriafigure1.jpg

你拿几层橡皮泥饼,拿根牙签串到一起就行了。那么小,这点细节看不出来的。
6#
发表于 2013-9-23 21:33:59 | 只看该作者
水风 发表于 2013-9-23 21:29
动物模型反而更好办了,你把小东西给做出来,然后拿一个气球,把东西塞进去,然后保证细胞核在中间,往里 ...

气球壁如此的柔软,如何能保证灌注施工的过程中那些小零件的位置呢?
气球只能起相当于细胞膜的那一层的作用。
但是灌注施工的时候应该有个比较硬的壳子在外面撑着,否则不是全塌了么?
7#
发表于 2013-9-23 21:41:50 | 只看该作者
本帖最后由 东湖珞珈 于 2013-9-23 21:46 编辑

这样的,细节够不够? 是否准确?



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8#
 楼主| 发表于 2013-9-23 21:42:15 | 只看该作者
东湖珞珈 发表于 2013-9-23 21:23
橡皮泥做小零件那个,是解决了“透明悬浮”问题之后另外一个必须解决的问题。可能比第一个问题更难解决。第 ...

这些小东西,不必一次成型,你可以这样做,先摸上一层胶,等干了,再抹一层保证不会把内部结构粘到模具上了。然后丢进一个椭球形的模子里面去,等成型以后,出来拿美工刀自己把不需要的给修掉。这样,每个都不一样了。

我建议你让小东湖定个工程的时间进度表,每个细胞需要线粒体做几个?高尔基体做几个?叶绿体做几个?核内体(endosome)做几个?细胞核要两个,其它的每种至少要多做一个出来以备用。还有做成的模型最终的体积有多大?根据这个反过来推算每种细胞器的大小问题。他不先解决最终成型的大小,你现在做了也是白费。
9#
发表于 2013-9-23 21:45:55 | 只看该作者
水风 发表于 2013-9-23 21:42
这些小东西,不必一次成型,你可以这样做,先摸上一层胶,等干了,再抹一层保证不会把内部结构粘到模具上 ...

这些东西的具体物理尺寸也是互相制约的。
比如说要用明胶灌注的话,我们只能找到两个尺寸的“模子”,那这就决定了模型的外围尺寸。那内部的小零件的尺寸就必须根据这个来定了。
比如老师也指定了:细胞核不能小于整个模型的1/10的尺寸。
10#
 楼主| 发表于 2013-9-23 21:56:45 | 只看该作者
东湖珞珈 发表于 2013-9-23 21:33
气球壁如此的柔软,如何能保证灌注施工的过程中那些小零件的位置呢?
气球只能起相当于细胞膜的那一层的 ...

动物细胞在单独培养的时候,就是要塌下去的。只有在肌体内部的时候,因为周围的细胞,以及外在的皮肤和内在的结缔组织勾连起来,细胞才近乎是圆球形的。所以要在这方面挑刺,那么完全可以直接挑战而胜之。

你当然可以在灌注的时候用个硬壳在外面。但也可以不用。如果用浆糊的话,那么你是做不成凉粉那么硬的,也就是肯定要塌的。这个让小东湖去操心好了,你给出个建议就行了。他最终决定如何操作是他的事情。
11#
 楼主| 发表于 2013-9-23 22:05:01 | 只看该作者
东湖珞珈 发表于 2013-9-23 21:41
这样的,细节够不够? 是否准确?

这个倒是够了,但是你确定你要这么做么?做一个完美的模型出来,靠你家的手工作坊,要一年以上的,你只有10天,阿,不到了。我建议你每个细胞器做一个切开的即可。或者压根就不用考虑切开的问题。

正常情况下,大多数动物细胞的细胞核的直径不小于细胞直径的1/3,植物细胞不小于1/5。也就是动物细胞5微米直径的话,细胞核要至少1。5微米。换成你的模型,直径30厘米的动物细胞,应该有一个直径10厘米的核。你要注意,并不是所有的细胞都有非常发达的内置网(ER),所以你可以考虑只做一个60度扇面的。

我不建议你做鞭毛,可以考虑做纤毛(cilia)。

植物细胞里面,叶绿体可以做的很大,但不能超过细胞核的一半。

点评

谢谢建议  发表于 2013-9-23 22:19
12#
发表于 2013-9-23 22:25:05 | 只看该作者
水风 发表于 2013-9-23 22:05
这个倒是够了,但是你确定你要这么做么?做一个完美的模型出来,靠你家的手工作坊,要一年以上的,你只有 ...

能否麻烦你找一个你觉得难度适合的样品?一张照片都足够了。
你认为怎样的是可以现实的在10天里面实现的?又表现了足够多的细节?
13#
 楼主| 发表于 2013-9-23 22:39:16 | 只看该作者
东湖珞珈 发表于 2013-9-23 22:25
能否麻烦你找一个你觉得难度适合的样品?一张照片都足够了。
你认为怎样的是可以现实的在10天里面实现的 ...

动物细胞的话,我比较喜欢下面这个,因为它相对简单,
http://www.ebi.ac.uk/microarray/biology_intro_files/cell.jpe
更简单的话,考虑这个。
https://encrypted-tbn0.gstatic.c ... WRxlurXP5zDAR1ZcNFb

还有更加简化的
http://www.stemcellschool.org/
注意看右边的图片。

植物细胞
你们家小东湖的那个就不错看。

http://www.biologycorner.com/wor ... t.html#.UkBSOLyyP5s
或者选用这个,
http://micro.magnet.fsu.edu/cells/plants/images/plantcell.jpg
注意细胞核周围的要简化。


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