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[科技前沿] NIH再次设立funding支持新一代纳米技术的测序研究

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发表于 2012-9-20 05:04:10 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-19 22:33 编辑
2 \+ y4 s- G* K1 ?( M$ B! S
, l+ E# d7 Z& o  q% ]NIH/NHGRI准备出19Million去支持nano技术来降低NGS/3GS,maybe 4GS。
8 V; N* e7 Y- N( n
) i' N) {+ U) [6 ^2 nhttp://www.bioresearchonline.com ... amp;source=nl:35056* {& l0 }8 ~  S- r8 T3 f; g

3 s9 i4 i" |( F  a) m( c: I! a* u9 f现NIH director好像是原来的NHGRI的director,同时也是Human Genome Project,一个所谓的international collaborative project的leader。4 u# p/ R3 l  ~) O

3 B1 r2 N3 [2 t# M4 I3 A; Q" f1 {% X% `  i, ?; W9 I
. E5 a& a' S! Q; r, g
Sequencing的成本在最近的四、五年中,绝对是dramatically的下降。在可以预见的将来,personal genome已经不再是梦想,而且将其发展为新生儿的标准检测之一也并非不可能。事实上,现在10k左右的价格,对癌症病人的医疗开销相比而言也不算什么。这个潜在市场的效益应该还是不小的,不知道会不会使美国health care方面的开支在GDP的比例从1/5变成一个quarter。: s' H- U- \" O! c; @; v% x: G

2 g# w3 C, s+ O+ N4 P至于用处,在没有足够clinical patients' genomes的情况下,molecular diagnosis的全面使用还不是很靠谱,毕竟microarray探测不出新的东西,虽然深度分析加上对现有知识的总结能够发现一些东西。换句话说,FDA/NIH极力推动的personalized medicine还有很大的挑战。但即使如此,这方面的研究已经对癌症的诊断有了贡献。像breast cancer中的几个重要的biomarkers,还有就是几乎成为每次必讲的Nicholas Volker(US clinics quietly embrace whole-genome sequencing),都已经显示出来这个方面的研究潜在的巨大应用前景。而癌症的早期发现,对于治疗有决定性的作用,像breast cancer和prostate cancer的早期发现的治癒率或者控制率几乎将近80%,而到晚期,基本上就靠人品了。 ; S/ P" M. _3 }' v

& H. I3 i. F( i$ g+ I8 a在令人沮丧的Pathway Genomics-Walgreen-FDA事件(http://www.cnn.com/2010/HEALTH/05/12/genetic.testing.walgreens/)两年后,上个月初,这个领域的著名公司之一,23&Me向FDA递交了510(k)(https://www.23andme.com/about/press/fda_application/)去推动FDA在这个领域的regulation的制定,照23&Me的说法,这是工业界第一次推动政府监管机构制定相关准则的尝试。% F! s7 ], V, p, z  O8 P  X0 [
5 l) ~/ B7 D) r* v
当然,这项工作涉及到的不仅是技术上的问题,还有法律,政府监管和医学道德的问题,有很多地方都没有明确的规章制度,虽然早在08年的时候,国会就已经通过了GINA(the Genetic Information Nondiscrimination Act)法案。在国内,SFDA也没有统一的规章制度,据说各地的SFDA拥有相对大的灵活性,事实上,已经有一些海归背景的公司和机构在搞这类东西,但无论是资金还是技术力量和美国还有很大的差距。有意思的是,在这个领域比较兴盛的地方,基本上就是boston地区和南/北加地区,特别是北加地区的公司大部分都集中于硅谷,和google等等为邻。0 }) p' b' ^; |; G. J) t

- L4 w" M1 V2 K" m2 X+ l3 p; J- J" u  a在众多的NGS/3GS公司中,Complete genomics以提供一个完整solution成为亮点之一。其特别的技术以及深度的分析,至少现在对临床方面会是一个比较好的选择。当然如果成本能更快的降低,加上拥有中国中央和地方政府支持的BGI的强力跟进,希望市场上不再是Life旗下的PGM如日中天的声势。BGI的加入,是否会和Hitachi有千丝万缕关系的life在这行形成所谓的中日之争,我们将拭目以待。* h* z  u) W% @' x$ e, y

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