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[科技前沿] NIH再次设立funding支持新一代纳米技术的测序研究

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发表于 2012-9-20 05:04:10 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-19 22:33 编辑
& i- M$ z3 F5 H! e; G
! w/ h7 J+ z  Q( E8 |NIH/NHGRI准备出19Million去支持nano技术来降低NGS/3GS,maybe 4GS。
, k# v, d" _0 Z/ {9 j( J* o
/ K4 m7 y4 |) chttp://www.bioresearchonline.com ... amp;source=nl:35056
1 f) p  H5 W- ~  @% K
, D% S  L1 n& d- _" v现NIH director好像是原来的NHGRI的director,同时也是Human Genome Project,一个所谓的international collaborative project的leader。1 E' H; r1 k5 u! O% }% n
3 k% D9 N( j3 E) L& q4 D" e

0 H5 J  K3 x; j8 t/ f( X' }$ W* G: m( Q
Sequencing的成本在最近的四、五年中,绝对是dramatically的下降。在可以预见的将来,personal genome已经不再是梦想,而且将其发展为新生儿的标准检测之一也并非不可能。事实上,现在10k左右的价格,对癌症病人的医疗开销相比而言也不算什么。这个潜在市场的效益应该还是不小的,不知道会不会使美国health care方面的开支在GDP的比例从1/5变成一个quarter。! q5 h4 @* w9 c7 c8 E
$ W  r5 r+ x: w5 d: L, c6 c
至于用处,在没有足够clinical patients' genomes的情况下,molecular diagnosis的全面使用还不是很靠谱,毕竟microarray探测不出新的东西,虽然深度分析加上对现有知识的总结能够发现一些东西。换句话说,FDA/NIH极力推动的personalized medicine还有很大的挑战。但即使如此,这方面的研究已经对癌症的诊断有了贡献。像breast cancer中的几个重要的biomarkers,还有就是几乎成为每次必讲的Nicholas Volker(US clinics quietly embrace whole-genome sequencing),都已经显示出来这个方面的研究潜在的巨大应用前景。而癌症的早期发现,对于治疗有决定性的作用,像breast cancer和prostate cancer的早期发现的治癒率或者控制率几乎将近80%,而到晚期,基本上就靠人品了。 ( n  P" Z4 w) |+ c7 m$ N

5 c( t; n+ d; k/ D在令人沮丧的Pathway Genomics-Walgreen-FDA事件(http://www.cnn.com/2010/HEALTH/05/12/genetic.testing.walgreens/)两年后,上个月初,这个领域的著名公司之一,23&Me向FDA递交了510(k)(https://www.23andme.com/about/press/fda_application/)去推动FDA在这个领域的regulation的制定,照23&Me的说法,这是工业界第一次推动政府监管机构制定相关准则的尝试。. N& h$ Z  U, j6 z5 t

2 R1 G1 m" v  A! P& l4 d1 P当然,这项工作涉及到的不仅是技术上的问题,还有法律,政府监管和医学道德的问题,有很多地方都没有明确的规章制度,虽然早在08年的时候,国会就已经通过了GINA(the Genetic Information Nondiscrimination Act)法案。在国内,SFDA也没有统一的规章制度,据说各地的SFDA拥有相对大的灵活性,事实上,已经有一些海归背景的公司和机构在搞这类东西,但无论是资金还是技术力量和美国还有很大的差距。有意思的是,在这个领域比较兴盛的地方,基本上就是boston地区和南/北加地区,特别是北加地区的公司大部分都集中于硅谷,和google等等为邻。
! v# g9 n- d  I
/ M' C% K$ j1 q% C2 }在众多的NGS/3GS公司中,Complete genomics以提供一个完整solution成为亮点之一。其特别的技术以及深度的分析,至少现在对临床方面会是一个比较好的选择。当然如果成本能更快的降低,加上拥有中国中央和地方政府支持的BGI的强力跟进,希望市场上不再是Life旗下的PGM如日中天的声势。BGI的加入,是否会和Hitachi有千丝万缕关系的life在这行形成所谓的中日之争,我们将拭目以待。+ r4 }6 f5 Z* o& u3 e

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