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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 ' j' |# N) `3 Q& f' E1 c; j+ r

* S, T% N. z" j! E  u最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。- {) g5 K, W) @! H# L# D
; E5 Z2 G( d0 O
事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。
) f8 v( L- q- k+ Y# F) w8 s
: L, O) @' ^. o某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    2025-3-30 11:48
  • 签到天数: 1064 天

    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
    5 C: o7 P  ~6 u$ B5 c/ r
    martian 发表于 2012-9-15 02:37 6 |- }5 u( X0 c. ~+ {1 A
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
      r" {& j/ j: v  a" I4 C0 w

    8 t, S  a  `1 @2 S8 q% d7 IMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
    $ k1 ^$ \6 @1 @+ D1 [7 H. g8 w; M* E2 L* p1 U/ ^* E: `
    Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html9 e5 |. g/ j9 w4 f. S
    这个似乎全文是免费的。
    4 J* q  L0 f- m% {# Y" [% n# `2 R1 \+ W) E/ [
    Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
  • TA的每日心情
    开心
    2016-2-18 04:19
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    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
    / W; u' U9 n; X( }1 f8 o4 |不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    , [3 d% x3 T7 K5 u8 h1 r/ i- M$ I: c  O
    7 v" ^4 v3 y& ?( d, M! L3 M! J  W4 s

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    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05 ; |; I* C, g3 J
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。8 [* D- p4 I4 v! K" Q, p) Y* L
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    $ v1 M! R9 P! K5 _5 ~/ R
    看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?- e, d8 {! Q4 t

    ; P* ^2 p  s/ ], K  q慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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