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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑
( V/ L* A! ~7 s7 g" r  f0 |: m: h% T) i
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。
% o+ `+ C) f  H5 p, i
. b1 [: G" n% k6 b- [1 t: t* [事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。
& Y' `& ~0 z4 d2 T+ s* o3 X. `. \8 ~9 ]3 u& g  E, \: A
某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    2025-3-30 11:48
  • 签到天数: 1064 天

    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
    0 W' i3 L. ]2 F
    martian 发表于 2012-9-15 02:37
    % E5 A4 T, r. j: Y* V有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
    ; R3 q/ z; q. E/ C8 w

    , q% h& P4 E- |6 L) FMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm6 r7 k1 v) t, M9 g2 y9 J5 h1 ^/ h

    $ M, r" x' C0 H2 VMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html9 D/ z5 _* l' _6 b2 R
    这个似乎全文是免费的。
    ! q7 V: ^5 ^& m. i/ f" M5 g
    " H& g/ s+ t0 B: O& S8 mBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
  • TA的每日心情
    开心
    2016-2-18 04:19
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    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。1 H% ?- R& K. H8 w' p, q+ B
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    ! L9 i$ F/ \8 ?+ E
    1 l" ^: |3 d4 u3 n* \- d- ]
    3 i9 e# ^( O6 {; P8 ?

    该用户从未签到

    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05
    2 m+ o: J5 \1 C- K: M* b' C有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
    1 g- s  D* u7 Q不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?

    1 T  k5 O+ \+ C. F! {: K. E看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?* a& P6 L. `: U! B' a8 h* `, l
    5 I5 K6 \" X* C1 F+ V/ v, K4 _9 n
    慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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