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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 " X0 F* }9 H5 |! r" v
7 L2 G- z) {8 m* e1 [% t/ a
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。1 H$ x6 l. A4 J* p6 @) f

8 ~/ I" B: l1 u$ I/ \事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。; m4 D* r+ {+ B/ H5 P0 n
1 x/ s" E( \1 W0 ?- E1 a; Z* t
某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    2025-3-30 11:48
  • 签到天数: 1064 天

    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
    : v5 f# b/ \4 H" |7 M; E0 |9 V7 ?
    martian 发表于 2012-9-15 02:37   O4 _7 B* [' v
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
    , J6 [. ^6 N4 v3 [0 G5 n

    7 c& u$ Y, L! z$ l# kMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm$ Z: b, t0 {. u# J; g0 X

    & u6 M6 f7 e3 z  t8 h3 OMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
    / N$ P& w/ g9 @6 i8 k这个似乎全文是免费的。% c& o5 w$ A) ?* A# j3 Y, i% l% @

    & k- B8 Y+ N. b* a! _1 H) bBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
  • TA的每日心情
    开心
    2016-2-18 04:19
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    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
    2 {, O& F  W% r0 P; j/ ?不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    3 u: `# e/ u/ j4 O, ~4 j+ P# W( y% R6 H9 h8 k( P2 [

    ( K1 v6 d# @- ^+ ?

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    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05
    % K/ P1 S4 _  w  D有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。/ O3 s3 N* v2 w- p' B! f- f
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    # m( F# V* M3 \6 N  I! s3 h
    看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?
    * f2 a8 r- a7 f
    & n% j8 _$ [8 O) i6 t慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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