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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 ) H8 d( z5 U  [! _2 Y% ?, A

. S" |- [7 v8 A+ z; t最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。
6 Q* ?0 l' V; R, i
$ q7 `# X' I; c+ q) c9 p, ~2 G" P事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。
/ s" C2 [) g% o$ a, P9 r$ d2 r  H: L% U/ w( o
某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    2025-3-30 11:48
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    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 % P% Y+ m: v7 f& S& t; w+ U
    martian 发表于 2012-9-15 02:37
    1 d$ L" E, Y) l0 }: ^  s+ _/ h有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
    ! f7 }% y+ e6 s; a: z6 [

    9 l3 q# I0 Z; GMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
    ' ?) p! r' h) N9 G& G6 d; l+ z  n4 p, a! z. M: L& F% w( I/ B, T0 S3 W
    Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html8 }2 i( V6 O6 w
    这个似乎全文是免费的。9 P& n/ r& X* T/ `& k

    8 o* z" _: j& p1 g% Z7 d% TBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
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    开心
    2016-2-18 04:19
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    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
    3 |! ^: i& j' ]0 B( c不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    2 t8 V6 V' ]+ e! {! z* a6 G' E6 h: e0 c
      y, D" Z, Q8 N: I

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    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05
    - ~$ C1 x4 h9 J$ p3 f+ X有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。- g4 T5 R: @* t  l
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    , S' [9 _$ v' v( e
    看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?- f3 M' H; q% a, @+ h

    ) V8 K3 X& \  K# M7 K. d% U  M$ \慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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