基于“拔河”的HT Chip

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2 M9 [. c6 b2 z- \( \最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
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! O8 }; W- m6 w, o  T事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。

7 W6 c: [* T; T+ w( }+ R某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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martian 发表于 2012-9-15 02:37
, Y  X4 J7 c: p) z有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

7 u& {, F) R5 k/ Y" ]! EMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
# ^1 L: \7 i9 r9 @
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
9 V6 I( g7 w; j: R, Z2 v, h5 k7 [这个似乎全文是免费的。
1 \) t  Q& _2 s8 S
3 J, `8 C3 v3 p% K. s& Q: fBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
' U" ^) k) c. f不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
7 \# T9 B4 s; Y. h. l有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
3 h) C9 }$ r- o, x0 @  }1 B4 s不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。