基于“拔河”的HT Chip

喜欢喝冰茶

1 j3 b) v' z) H" ]7 m& e
, }2 [! g/ G0 `1 I最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
- F) Z( ?+ g+ P, l4 [$ F3 R) ~! z6 q
2 Q5 _6 ?& t, Z事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
: }2 @* J5 H" _
3 D2 Q! f' J) X, U) \某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

喜欢喝冰茶

% Y& T- U$ p0 t# l

martian 发表于 2012-9-15 02:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

5 n9 F! y( W: F+ K" a% V4 ^Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm

Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
1 T2 r" Y1 U# a7 ]- `5 H4 F" n这个似乎全文是免费的。
: f8 ?7 k  Q9 y( T$ f( u$ Z
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
8 \1 C/ U+ y; s3 {& ]9 {+ d不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

喜欢喝冰茶

隧道 发表于 2012-9-25 02:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

) g. V2 |' {4 b1 _( M: Z看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
: p- \4 _5 g9 _* m# T, Y
: a9 Z6 `, P! d  S" g; Y慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。