基于“拔河”的HT Chip

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' j8 c* |( w" a( d- _( k最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。

+ k- `+ z: x# g事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
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某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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martian 发表于 2012-9-15 02:37
4 i/ Z& I5 m; V. y  K( c: ]6 C/ \2 T# D有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

+ p. S( \' Q  W7 Z/ r0 h2 d5 `! K, M% Y
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm

% S( M: Y9 p  ]2 H! HMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
9 ~& a0 g3 ?/ w7 |这个似乎全文是免费的。
, P% g. P  E3 J- c& w/ Y
1 Q8 T" c: g% u4 [8 ZBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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隧道 发表于 2012-9-25 02:05
, _8 W3 |+ c) \# z3 [6 P$ D* N有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

4 x% L5 n# N' t4 z+ \' x0 o看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。