基于“拔河”的HT Chip

喜欢喝冰茶

9 Z1 {9 v% P- }+ N! ]  w
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
/ {1 Q8 a: F+ y! z$ B4 _$ D
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
  V7 Y/ s" E  Z  n# W- ^2 h1 r- k$ c
某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

martian

有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

喜欢喝冰茶

6 }% j5 J  r* I6 U6 I- h3 I

martian 发表于 2012-9-15 02:37
0 r2 W6 d" N- L9 v" s& z% X& g" t有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

) K3 O0 K+ f+ {- J
9 v, ~( J) c* `+ W* F; s6 t/ s: CMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
: c+ S4 s: m; P/ i. W) b
  J, _2 \1 P( c0 p% b0 e+ y2 tMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
这个似乎全文是免费的。
/ i7 Q; \# H, A2 I( x1 k
6 r7 I+ o7 F! A  V3 Z2 EBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

隧道

有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
! H& B. p2 @1 b5 T! O不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

  m/ `7 V3 _3 U  t2 D" a, Z4 [

喜欢喝冰茶

隧道 发表于 2012-9-25 02:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
1 C, W/ l2 i* M% F3 n$ D不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

* l$ Q/ R6 t6 }5 h4 B; H看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。