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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 1 p& h+ C6 a  D+ e6 U0 Z
$ ?& M0 A* R1 e4 d1 K
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。
) p$ O1 g% k: @, y% @# e& a7 ]$ J6 b; f: N3 M$ d
事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。
" E# r% @$ {, q( D, Y
: c, e# Y$ n; X7 t& n8 D6 N某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    2025-3-30 11:48
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    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 ) [  U6 y# M. _
    martian 发表于 2012-9-15 02:37
    : E0 z# P# h2 h" ~8 U有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    5 b8 s. |# w/ C% M% s  O7 ^, u. A1 f7 n4 g3 L. i/ V5 ^( J( S
    Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm& n% a5 C/ i0 N# f' M8 G. a
    % V9 a# |7 a3 A$ P
    Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html# y+ O, L' w) J0 d9 S
    这个似乎全文是免费的。" F2 H/ |' ]- F% L, R! ]" s
    # z, O, @: f) G: J* i* m$ t
    Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
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    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。! L+ s1 v/ K: A
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    $ u. d9 V% n- @* M. {
    $ ?- |% g: g: h+ V8 ?0 s: X* n& K& u0 E/ D( {: t( U

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    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05
    # f, C+ w7 C( b3 C有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。2 D% @, O1 L& T
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?

    ) Y/ Z) t( m' V' `$ `+ d看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?
    7 R6 [- J; _$ G7 X& U2 g1 M% e% g6 i: [& n# c. R. `. E4 p
    慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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