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[科技前沿] 基于“拔河”的HT Chip

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楼主
发表于 2012-9-14 22:55:13 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑
/ _  f/ D6 X# M" X2 P
! k7 v# ~7 N2 ~* P最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度,是现在热炒的NGS/3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助,同时也对structural variation的理解有益。# M- K" H" w2 d- ^) _

9 h% V! t7 I8 o4 M2 I; l! V0 w事实上在“拔河”比赛中,至少对于protein,无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中,加州的研究人员一直处于前列,例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力,对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助,特别是对于临床,例如Cancer Genomics。
3 ?$ l7 b6 w. D4 F/ _) a3 P8 V- ~6 K$ k; h
某种意义上来说,“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程,看看等忙完手边儿的一些项目,有时间写个“搭积木”的姊妹篇,“我和春天有个约会”,哦!是和胖胖蛋白有个约会。
  • TA的每日心情
    开心
    2025-3-30 11:48
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    [LV.10]大乘

    沙发
    发表于 2012-9-15 16:37:48 | 只看该作者
    有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

    该用户从未签到

    板凳
     楼主| 发表于 2012-9-15 20:47:07 | 只看该作者
    本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
    ! W3 a3 b) i4 q' T, |
    martian 发表于 2012-9-15 02:37
    + A' ?) D9 ~. K9 g: m7 U: `有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
    ) M. L) Y1 D9 I; y2 T! {
    9 \* K0 g& {2 D; x) r2 P& Z1 J
    Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
    + u. K1 L2 y3 `' i+ Y) D, m$ T( u/ G
    Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html2 K- j  J- ?- m& A/ {7 [2 l
    这个似乎全文是免费的。
    4 f& h/ @- c: o6 G5 U; g' a' A; @; t& Z: Z7 e1 |3 K; c2 m
    Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
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    2016-2-18 04:19
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    [LV.1]炼气

    地板
    发表于 2012-9-25 16:05:25 | 只看该作者
    有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。  j9 S7 [* U* k
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    4 j1 A9 j/ @' i% K3 ]9 m" S7 o' I
    + ?+ R7 S5 Z3 e$ ^5 C
    / Y( T0 h; j) ?$ M

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    5#
     楼主| 发表于 2012-9-27 11:53:22 | 只看该作者
    隧道 发表于 2012-9-25 02:05
    3 d2 D* A* w4 f- D有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。) S) s  \5 I7 |4 e- ^" n
    不过单分子力谱得到的数据有多可靠?收集数据有多快?
    * @0 x! S; f$ i3 b; d4 \+ {
    看着还行,开始出来的东西,不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗?
    ; M- x: X, {4 W2 B6 E- B7 @) e7 ^' z( Z# q5 D; K' H7 E' f
    慢慢来,至少部分的能够得到一些3D的信息了,现在的HT技术还做不到。

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