string1: TACGGCATGGCTATCGTAGCTAG4 C( q3 m! F0 ]& \% l& Z1 g0 r
$ @0 n- I7 c9 n: r
string2: GCTAT
要求在string1里找到string2的位置,如果存在多个的话,都要找出来。
如果两个字符串是这个样子( A: i, A9 d# M5 v* ?
5 S% {$ y3 E4 N `# K
string1: AAAAAATTTTCCCCCGGGTTTTAAAACCCCCCGG+ `- y* ^: S) j. x# b; u
string2: TTAAA
MacArthur 发表于 2013-10-6 21:35
不明觉厉。。。 上Billion字节的操作,想想就头大。。。 这个规模是不是得上并行计算了?/ w) h h: ~6 M8 R, k
...
chalet 发表于 2013-10-11 20:29 : a* |# d0 K7 b
我可不是作生物计算的,是学临床医学出身的,而数学正是我的致命伤,哭啊~~~* f" Y! U# T0 x" E" S$ ]7 s; |
那是上一轮生物技术泡沫的时 ...
喜欢喝冰茶 发表于 2013-10-12 15:10
兄弟原来是医生,幸会幸会,我的很多合作者都是MD。
& X" k# a' B' c& P& w0 d" M
呵呵,03年太早了,HGP刚完成,那会儿还没看出个所 ...
喜欢喝冰茶 发表于 2013-10-13 15:04 - w N' _( b2 U5 s
cDNA算是经典的array了,该不会在程氏公司吧~_~。现在mRNA的expression,特别是经典的几十个癌症基因的 ...
chalet 发表于 2013-10-13 21:20 2 M- R8 B) m; {) \# [
我对当前这个领域的研究有2个观点:
1. 当前这种研究思路,有点花大本钱做剥丝抽茧的小事的味道。一方面 ...
一叶飞刀 发表于 2014-11-15 07:016 R0 p' b6 T0 l% p9 j; u1 P7 n3 E
关于字符串匹配,应当已经解决完毕了,大概不会有更高级的算法了。
6 g, u$ b- b2 W/ U" _
从S中找ss简单匹配算法为用ss的第一个 ...
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