爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑
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& R1 C5 m) v" }% T% o最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
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事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。9 ^3 e4 x# q- {6 c- H0 d! S1 R
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某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 ! G% i( Y, ^* J  d; Z, I
martian 发表于 2012-9-15 02:37 1 P5 s1 ?' c& z+ x; ?; ^* f0 W
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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! t% T: T* Z" R# K: vMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm4 w# e; k4 h8 Z% J. }: F; F

5 \, w- r) r% c6 N/ cMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html* J5 q& r) t3 `
这个似乎全文是免费的。0 r' N& j4 ^; s

. K6 h6 x' k5 NBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。2 ?# S. v7 u) B  q5 B
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？1 O" O7 F) \& V6 h( E% }& z% Y( u

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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 3 w& A; B4 ~* c* L/ I8 x0 d  A
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。1 Y$ l8 M: e* W$ c# x! g+ N$ o
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

! `  e5 h8 B. B, G5 D看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？
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2 W0 @! p' |4 J# N4 n$ T2 Q慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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