爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 + L" w/ {, s) F! H) C) W
% {/ a7 H; L8 G9 C2 G% Y! i
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
& p! L2 j/ }8 ?/ j8 u% O4 p% j: r5 T! e7 m* L
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。8 K& P0 [6 S  k( o

7 t( j4 C( y: E2 r某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
7 L" ?0 C/ V! W
martian 发表于 2012-9-15 02:37 + R& K$ N+ Y$ @* e
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
; s7 N, i. ~) F6 I3 b- ?( t
$ N, f1 l$ Q. C! [- {1 l* W' x" R
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
) Q6 ?5 T  x! [1 a
7 F8 k7 v% V/ O1 Z" TMethods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html# ~$ D- d) p$ o
这个似乎全文是免费的。% h; i. a' D+ M
8 G( W$ r5 U) d4 U  ~6 q. C& g/ s
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
7 n" N; \: `9 [% t不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
" x& J9 \* Y6 W$ ~- Y* x+ z$ m
% U- F) h% @7 o) L
4 A2 [& v; Y- D
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05
0 k/ {$ t! P5 L- L% n8 \+ `4 g有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。4 }! |( V3 x. p' i  q$ V* _
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
) n. Z6 ]+ {3 C
看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？' ?! |! e2 @; A5 ~3 ]5 c9 C9 M

- Y/ p" s+ g1 O5 _' u$ e7 n' c慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



欢迎光临 爱吱声 (http://aswetalk.net/bbs/) Powered by Discuz! X3.2