爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑 ! ?: Y, [" B" t  g+ q
, l0 `! H6 ^" p( ?! W, M
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。) X. |) u; z6 r# x

3 r! q. ?7 z) f事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。2 V& Z" X+ Z  X5 Q; L) {8 D

# [& l1 W0 ?/ a' H) S某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
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martian 发表于 2012-9-15 02:37 , v0 {5 h0 d6 u3 P
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

5 C% c2 A# }9 ?: F! J5 p& d. o$ P8 F# u3 l+ _5 M& |
Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm$ W8 P3 B  p: o; D
, m6 P2 @) g6 N) Y/ ]
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
( G/ n3 s1 N3 |这个似乎全文是免费的。8 u0 G, k+ s8 a3 d0 M- G

- a- n) Z' @" T% J) v( {# Q9 iBiotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
- @1 F! r) u6 {/ b4 w4 C/ w# c7 W不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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0 z' I3 |0 s5 x1 |/ S! e4 s6 k% w3 K& x2 N/ f6 [  e. U7 a
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 " A8 U0 f; g+ h  D1 n
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。! o  d7 A* N7 a( h/ ~6 k4 k
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？( t; C9 E6 r# v  \) j% h
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慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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