爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]

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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip

# X- N6 F* F0 q$ n2 z5 ]
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。
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+ @) }2 c  Z% B/ ~事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。
2 j" @1 c  x/ U7 H
某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。

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作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47

martian 发表于 2012-9-15 02:37
& K( L2 u) e6 F; I+ [9 w8 T7 K7 x& S) B有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

5 |9 N8 a. u, P- T- |' T# ~2 |Mehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm
' r! w+ P  [: U' H5 _9 ~
: x! u0 m' d: P* v% y. ~Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
) [! {1 y; F: [' n$ m+ P4 @5 a" ?这个似乎全文是免费的。
: C( M- O0 W3 p# N
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562

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作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
; o  `; U$ f9 u% J$ `7 d* c9 l
4 o+ N4 h, P9 R" C+ i6 O

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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53

隧道 发表于 2012-9-25 02:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

* }2 C9 d: z+ K7 L! G5 \看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？

0 E5 ]# v$ C& k; W5 A6 j; b% U慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。

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