爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑
4 l* t8 P' a# ]
7 _* u1 l8 R6 t; V: Y) R6 K7 W4 [最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。/ S% X- t4 p+ K$ [, M# u
& ]3 v+ ^* \7 W) u, L* S
事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。  y: Y, a/ ?" _0 W% x- r% I: {
3 b1 ]& ^7 ~5 N" W/ l
某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑 " o, ^: X7 i& H% o4 O
martian 发表于 2012-9-15 02:37 8 P! V' e6 L+ A- Z1 n
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

" S" g3 e% k% b" ~1 p8 ]  l4 l# q
& O$ }+ {4 D' h$ m8 m, EMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm2 v( p  _  {0 }/ O' ^
8 g% R& j" i7 H. f( @" e
Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
. y) d# w: u5 b这个似乎全文是免费的。
5 k* f) M% Z' b1 w. }- h! S0 |+ X4 v
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
. Q9 A  g$ x- B6 d) a! S不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？! s' a7 f: {2 v6 `) l

- C5 A2 ~/ A6 t; Y+ O: m
' i) Q/ z0 E, A/ n* z' M
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 / {5 i) G% r- i+ S5 J1 r
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
; F$ |2 d- _  J" `5 I) ~+ e不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？

+ e! ]& d1 j' ^5 [" t看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？& q- X! ]( g% r9 [9 p  E& c3 Q* |$ U
' x( L4 g( X7 Z. ~
慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



欢迎光临 爱吱声 (http://aswetalk.net/bbs/) Powered by Discuz! X3.2