爱吱声

标题: 基于“拔河”的HT Chip [打印本页]
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-14 22:55
标题: 基于“拔河”的HT Chip
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-14 22:30 编辑
3 U. _  |3 \0 d4 g% v. w6 X8 {% ~: Y, Z5 x
最近的Nature methods和 biotechnology上谈到了一些基于“力”的High-throughput chip。超过100kb的长度，是现在热炒的NGS／3GS难以望其项背的。特别是对现在大家都不知道的重复性DNA区域的研究会有帮助，同时也对structural variation的理解有益。0 X! @2 ^# c. x$ G

% y) @+ T  c- |3 y事实上在“拔河”比赛中，至少对于protein，无论是实验技术还是计算技术都已经有一、二十年的历史。单分子力技术的发展中，加州的研究人员一直处于前列，例如现能源部长。但是最近大规模将其转换为应用领域的努力，对DNA整个的操作机理会有可以预见性的帮助，特别是对于临床，例如Cancer Genomics。* R2 K  E6 r' l) ]

- \4 {9 d. n+ B* I3 b, L. N" P* ^某种意义上来说，“拔河”比赛和"搭积木"是个相反的过程，看看等忙完手边儿的一些项目，有时间写个“搭积木”的姊妹篇，“我和春天有个约会”，哦！是和胖胖蛋白有个约会。
作者: martian    时间: 2012-9-15 16:37
有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.
作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-15 20:47
本帖最后由 喜欢喝冰茶 于 2012-9-15 20:33 编辑
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martian 发表于 2012-9-15 02:37
. }# B6 W6 }! m  t  W. g0 V有没有报道的链接?有兴趣了解一下,我是做ngs的.

! }2 R- j+ h& r4 f/ x
" I$ L! w4 Y5 Q- h0 iMehods: DNA: stretch for the camera, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2166.htm, c: \4 A# T& a

- N- C: o4 Y* r6 b. [Methods: Pulling on single molecules, http://www.nature.com/nmeth/journal/v9/n9/full/nmeth.2149.html
8 A7 N8 Z+ }" c, f8 f这个似乎全文是免费的。
4 a2 U- F$ J: S. s: ?  T& u: G0 Y, h! S
Biotechnology: Genome mapping on nanochannel arrays for structural variation analysis and sequence assembly. Pubmed ID: 22797562
作者: 隧道    时间: 2012-9-25 16:05
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。: A/ E+ S. T2 j! F/ f- K
不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
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作者: 喜欢喝冰茶    时间: 2012-9-27 11:53
隧道 发表于 2012-9-25 02:05 ( P1 X/ G4 `/ X& v. ~1 v( `) E
有点意思。没想到单分子力谱居然有这方面的应用。
- S5 f+ V6 l" t* @$ ?: E不过单分子力谱得到的数据有多可靠？收集数据有多快？
  v" Z: ^# s) \4 g% \) O
看着还行，开始出来的东西，不能指望太好。现在的microarray不也是经过十几年的发展才到现在的精度吗？' S- c9 E4 y( X* m2 D$ _9 ?

! h0 r& B" P7 R# v7 D) N1 p慢慢来，至少部分的能够得到一些3D的信息了，现在的HT技术还做不到。



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